Fallos con CSS

Esto de las cascadas de estilo me tiene loco. A veces funcionan, a veces no.
El gran dolor de cabeza actual son los doctypes. Se supone que debo ponerlos, porque así los browsers saben a qué atenerse cuando abren la página, pero a veces el resultado es impredecible. A veces uso HTML 4.01 y otras XHTML 1.0, y a veces las páginas funcionan con uno pero no con el otro o viceversa. La diagramación se despedaza y... me vulvo mono tratando de ver qué funciona mal.
Me estoy dando vueltas por muchos sitios en la web (entre ellos A List Apart, muy bueno como referencia), pero aún no doy con una solución.
Son las 00:16 y ya está bueno que descanse. A ver si mañana encuentro el fallo.